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RNAscope™ 在杜氏肌營養(yǎng)不良 (DMD) 基因轉錄動態(tài)和空間定位研究中的應用

更新時間:2023-10-24

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導語

杜氏肌營養(yǎng)不良(DMD)是由DMD基因突變引起dystrophin蛋白缺陷,從而影響細胞骨架肌動蛋白與細胞外基相連。嬰幼兒時期的DMD處于癥狀前期,骨骼肌尚處于肌肉代償期,所以臨床表現(xiàn)比較輕微,難以發(fā)現(xiàn)。有研究統(tǒng)計,從關注到診斷為DMD,平均需要1.6~2年,此時肌肉功能已經下降。因此,盡早對DMD進行早期篩查和排除診斷十分重要。

隨著空間轉錄組學的發(fā)展,ACD作為最早推出新一代RNA原位雜交技術RNAscope的企業(yè),其單細胞、單分子水平RNA檢測技術位于世界前列,可提供RNA在組織、細胞的空間表達信息,是推進基礎研究、提高診斷試劑精準性的利器。

最新研究


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2023年9月,來自英國倫敦大學和意大利費拉拉大學的研究團隊在Nature子刊Scientific Reports發(fā)表了題為“mRNA in situ hybridization exhibits unbalanced nuclear / cytoplasmic dystrophin transcript repartition in Duchenne myogenic cells and skeletal muscle biopsies" 的文章,應用了RNAscope原位雜交技術,研究了杜氏肌營養(yǎng)不良 (DMD) 患者的成肌細胞、肌管和骨骼肌活檢中的DMD mRNA量并定義了其區(qū)室化,深入了解杜氏肌營養(yǎng)不良 (DMD) 基因轉錄動態(tài)和空間定位。

研究團隊用RNAscope™ 2.5 HD Assay - RED試劑盒和2個探針(針對肌營養(yǎng)不良蛋白轉錄物的外顯子37-42的37-42 ZZ 探針和針對肌營養(yǎng)不良蛋白轉錄物的外顯子63-75的63-75ZZ 探針)對 DMD 永生化成肌細胞、DMD 肌管和 DMD 骨骼肌活檢進行了測定。


圖片圖片圖片


結果顯示,37-42探針在永生化成肌細胞(圖1)、肌管(圖2)和骨骼肌活檢(圖3)產生強烈的點信號(紅色箭頭),主要位于細胞核和核周膜,而小點主要位于細胞質;63-75 探針在細胞核和細胞質中均顯示出較小的點。另外,永生化細胞顯示肌營養(yǎng)不良蛋白轉錄信號顯著減少(圖4)。

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通過定量分析,在對照和DMD肌原細胞中,研究發(fā)現(xiàn)約40%的核DMD mRNA定位于核仁中,突變型DMD mRNA 數(shù)量在患者的生肌細胞和肌肉活檢中顯著減少。此外,突變型DMD mRNA區(qū)室化由于其定位向細胞核的轉變而在空間上不平衡。這種異常的轉錄物重新分配導致細胞質中肌營養(yǎng)不良蛋白信使的豐度和可用性較差。這一新發(fā)現(xiàn)也對 RNA 靶向療法產生了重要影響。


關于RNAscope®


RNAscope®是一種可在組織或細胞原位檢測單一分子RNA的原位雜交技術。它是基于ACD的雙zz型探針設計,寡核苷酸互補配對的信號放大系統(tǒng),通過酶催化底物,可在顯微鏡下看到熒光或可見光的信號。不僅實現(xiàn)了單一分子RNA的原位檢測,還可實現(xiàn)在一張組織切片上最多標記4個不同的RNA分子。根據試劑盒的不同,分為熒光試劑盒和可見光試劑盒。該技術可以應用到多種類型的樣本中,如石蠟包埋樣本,冰凍樣本,貼壁細胞,懸浮細胞樣本等。